使用肽而不是DNA来标记分子以加速药物发现

导读 麻省理工学院的一组化学家发现,使用肽而不是DNA片段来标记小分子可以加快药物发现过程。他们的研究发表在《科学》杂志上。开发治疗或治愈

麻省理工学院的一组化学家发现,使用肽而不是DNA片段来标记小分子可以加快药物发现过程。他们的研究发表在《科学》杂志上。

开发治疗或治愈人类疾病的药物通常是一个漫长而昂贵的过程。通常,它始于化学家将具有已知特性的蛋白质暴露于大量小分子,希望找到一种紧密结合的蛋白质。

该过程的一部分涉及预先标记小分子以在结合发生后识别它们。通常,这涉及使用短的DNA片段。然而,使用DNA的缺点是它的敏感性以及与某些化学品和催化剂的不相容性。在这项新的努力中,研究人员试图找到一种替代标签,以提高寻找新药的工作效率。

在他们的研究中,研究人员使用肽进行了测试,因为已知它们在更广泛的条件下有用。他们还发现,他们能够通过使用质谱法加快解码过程。

为了使用肽作为标签,化学家们首先使用树脂固定了研究中的小分子。这在小分子和氨基酸之间建立了联系。然后反复进行反应。为了创建一个库,树脂被切成更小的部分,每个部分都经过不同的处理。反应完成后,树脂重新组合并再次分流以进行下一次运行。

这种方法允许以比目前使用DNA作为标签更快的速度测试大量小分子。通过质谱仪确定可能的候选者后,研究人员使用软件将光谱转换为独特的肽序列。该团队还编写了一个Python程序来处理数据。

研究人员指出,除了加快寻找新药的过程之外,用肽标签代替DNA标签还可以创建更长的标签字符串——DNA只允许四个字母。另一方面,肽允许16。